微生物肥料是指通过微生物的生命活动及其代谢产物的作用，能改善作物养分供应，向农作物提供营养，调控其生长，以达到提高产量、改善品质、减少化肥使用量、提高土壤肥力、减少或降低病（虫）害发生、改善环境质量为目的的肥料。由于农业上应用的微生物肥料常和泥炭、有机肥料等有机质含量较高的物质混合在一起，所以习惯上把微生物肥料，俗称为‘’生物肥‘’或“菌肥”。