1， 两种或两种以上微生物复合

    两种或两种以上微生物复合的微生物肥料可以是同一个微生物菌种复合，如大豆根瘤菌的不同菌系（或血清组、DNA同源组）分别发酵，吸附时混合，在不同大豆基因型的地区使用；也可以是不同微生物菌种，固氮菌、解磷菌和解钾菌分别发酵，混合后吸附，以增强微生物肥效功效，采用两种或两种以上微生物复合，其间必须无拮抗关系。

    2，一种微生物与各种营养元素或添加物、增效剂的复合

   采用复合方式为菌剂中添加大量营养元素，即菌剂和一定量的氮、磷、钾或其中1～２种复合；菌剂添加一定量的微量元素；菌剂添加一定的稀土元素；菌剂添加一定量的植物生长激素；用无害化畜禽分辨＼生活垃圾＼河湖污泥作为主要基质。总之，无论哪一种方式，必须考虑到复合物的量＼复合制剂中ph值和盐浓度对微生物有无抑制作用。